中研院機構計畫屬國家型科技計畫之一部分，內容包括臺灣地區魚類、貝類、植物、原住民文物，近代中國歷史地圖遙測影像、外交經濟檔案，珍藏中國歷史文物（中原與臺灣考古遺存、金石拓片、簡牘文書、善本圖籍、西南民族學、明清檔案），漢語與臺灣南島語典藏，以及數位典藏資訊技術等。

早在國家型計畫開始之前，本院為支持且改善本院研究環境，己支持某些研究所或籌備處數位化部分文物和研究資料，迄今有成。其犖犖大者為歷史語言研究所之漢籍全文資料庫、近代史研究所之數位資料庫，以及人文社會科學中心之臺灣社會科學後設資料整理與資料網站。